Benchmarking of long-read correction methods

the effects of error correction methods on pronunciation accuracy

هدف از انجام این تحقیق مشخص کردن موثرترین متد اصلاح خطا بر روی دقت آهنگ و تاکید تلفظ کلمه در زبان انگلیسی بود. این تحقیق با پیاده کردن چهار متد ارائه اصلاح خطا در چهار گروه، سه گروه آزمایشی و یک گروه تحت کنترل، انجام شد که گروه های فوق الذکر شامل دانشجویان سطح بالای متوسط کتاب اول passages بودند. گروه اول شامل 15، دوم 14، سوم 15 و آخرین 16 دانشجو بودند. دوره مربوطه به مدت 10 هفته ادامه یافت و د...

LoRDEC: accurate and efficient long read error correction

MOTIVATION PacBio single molecule real-time sequencing is a third-generation sequencing technique producing long reads, with comparatively lower throughput and higher error rate. Errors include numerous indels and complicate downstream analysis like mapping or de novo assembly. A hybrid strategy that takes advantage of the high accuracy of second-generation short reads has been proposed for cor...

Leveraging long read sequencing from a single individual to provide a comprehensive resource for benchmarking variant calling methods

A high-confidence, comprehensive human variant set is critical in assessing accuracy of sequencing algorithms, which are crucial in precision medicine based on high-throughput sequencing. Although recent works have attempted to provide such a resource, they still do not encompass all major types of variants including structural variants (SVs). Thus, we leveraged the massive high-quality Sanger ...

Benchmarking of read mapping bias in allele specific expression analysis

the effects of keyword and context methods on pronunciation and receptive/ productive vocabulary of low-intermediate iranian efl learners: short-term and long-term memory in focus

از گذشته تا کنون، تحقیقات بسیاری صورت گرفته است که همگی به گونه ای بر مثمر ثمر بودن استفاده از استراتژی های یادگیری لغت در یک زبان بیگانه اذعان داشته اند. این تحقیق به بررسی تاثیر دو روش مختلف آموزش واژگان انگلیسی (کلیدی و بافتی) بر تلفظ و دانش لغوی فراگیران ایرانی زیر متوسط زبان انگلیسی و بر ماندگاری آن در حافظه می پردازد. به این منظور، تعداد شصت نفر از زبان آموزان ایرانی هشت تا چهارده ساله با...